原创药物研究院是中国药科大学的二级科研机构，郝海平教授兼任研究院院长，王广基院士任首席科学家；与南京江宁高新技术产业开发区管理委员会共同建设，依托双方优势资源，汇聚国内外高端人才和创新项目，以打造国家技术创新中心和“中国江宁药谷”创新枢纽为目标，成为校地合作的典范。

研究院聚焦于肿瘤、代谢性疾病、心脑血管疾病等慢性、复杂性疾病，突破新靶标发现与确证及原创药物发现的颠覆性理论与技术，以“新药创制+生命健康+生物医药研发全链条服务平台”为导向，共同推进创新药物（Best-In-Class, First-In-Class）研究、加速科技成果转化，孵育一批具有自主知识产权和国内外领先的创新药物。

研究院将建立“二中心八平台”，为企业提供多节点服务，发挥新药研发的“磁场”效应，全力推进中国原创药物的研究与开发。“二中心”指“原创药物研发中心”和“中药大数据及新药研发中心”，“八平台”指新靶标发现与确证研究平台、人工智能与中药大数据分析平台、药物筛选与发现平台、早期成药性评价技术平台、药物优化和绿色合成技术平台、功能评价与临床转化研究技术平台、智能高端制剂研发平台、和技术转移与项目孵化平台。